用動物、植物油制成的生物柴油不論是作燃料還是用作其它用途,都有很多優點。當然，除了優點外，它也具有一些缺點:

       1、生物柴油的熱值比石油柴油略低;

       2、它具有較高的溶解性，可以清理發動機的積炭，對發動機起到保護作用，讓發動機的使用壽命變久些。

       3、它作汽車燃料時 NOx 的排放量比石油柴油略有增加;

       4、原料對生物柴油的性質有很大影響，若原料中飽和脂肪酸，如棕櫚酸或硬脂酸含量高，則它的低溫流動性可能較差；若多元不飽和脂肪酸，如亞油酸或亞麻酸含量高，則它的氧化安然性可能較差，這需要加入相應的添加劑來解決。